Ａｍｂｅｒによる生体高分子シミュレーション入門

サイエンスハウス
Ａｍｂｅｒ研究会　

• 価格: 2,200円（本体2,000円＋税）
• 発行年月: 2011年06月
• 判型: Ａ５
• ISBN: 9784862810083

内容情報

[BOOKデータベースより]

１　分子動力学法の原理と生体高分子用分子動力学シミュレーションパッケージＡｍｂｅｒの概説（分子動力学法とは？；分子動力学シミュレーションはどのような原理に基づいているか―ニュートンの運動方程式；原子どうしに働く力はどう決まっているか―力場　ほか）
２　Ａｍｂｅｒで生体高分子のシミュレーションを行う―Ａｍｂｅｒチュートリアル（まずはＡｍｂｅｒを使ってみる―インスタントプロトコル；核酸のモデリングとシミュレーション―ｎｕｃｇｅｎとｘｌｅａｐを使って；Ａｍｂｅｒで用意されていない分子の残基表現ファイルを作成する―ａｎｔｅｃｈａｍｂｅｒの使い方　ほか）
３　Ｆｒｅｑｕｅｎｔｌｙ　Ａｓｋｅｄ　Ｑｕｅｓｔｉｏｎｓ（ＦＡＱ）（力場パラメーターの設定に関して；ＰＤＢファイルの読み込みに関わるトラブルについて；トラジェクトリーファイルの解析について　ほか）