バイオインフォマティクス

Ｐｙｔｈｏｎによる実践レシピ
Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ　ｗｉｔｈ　Ｐｙｔｈｏｎ　Ｃｏｏｋｂｏｏｋ

朝倉書店
タイアゴ・アンタオ　阿久津達也　竹本和広　

• 価格: 5,720円（本体5,200円＋税）
• 発行年月: 2020年08月
• 判型: Ａ５
• ISBN: 9784254122541

内容情報

[BOOKデータベースより]

Ｐｙｔｈｏｎとソフトウェア環境
次世代シーケンス・データ解析
ゲノム解析
集団遺伝学
集団遺伝学のシミュレーション解析
系統解析
蛋白質構造データバンク（ＰＤＢ）を使う
バイオインフォマティクスにおけるパイプライン
Ｐｙｔｈｏｎによるゲノムビッグデータ解析
バイオインフォマティクスのその他のトピック
高度な次世代シーケンス解析

[日販商品データベースより]

Pythonを中心とするツール群の活用例を具体的なレシピ約50で紹介。目の前の研究に活かせる。環境構築から丁寧に解説。〔内容〕次世代シークエンス／ゲノム解析／集団遺伝学／系統学／タンパク質／データ公開・共有／ビッグデータ／他

〇本書で学べること
・次世代シーケンス（NGS）データ解析の進め方
・FASTQ, BAM, VCFフォーマットのデータの取扱い
・Galaxyへのアクセス
・Dask, Sparkなどを活用した大規模データ処理
・Cytoscapeによる可視化
・主成分分析，決定木分析など機械学習の活用