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[BOOKデータベースより]
一歩進んだ解析の世界へ。バイオインフォマティクス・進化遺伝学の知識をフォローしつつ、ますます広がりを見せる「ゲノム多様性解析」を基礎から丁寧に解説。サンプルゲノムデータとソフトウェアによる、様々な解析の実践法についても網羅。
はじめに
[日販商品データベースより]シークエンスデータとクオリティチェック
多型の検出
ハプロタイプ解析
表現型の解析
集団の多様性解析
集団構造の可視化
集団サイズの推定
集団の分岐・混合
正の自然選択の検出
ターゲットシークエンシング
分岐年代の推定
付録A 解析環境の構築
付録B 各種ソフトウェアのインストール
付録C UN*Xコマンド
バイオインフォマティクスの広がりとともに注目を集める「ゲノム多様性解析」を、集団遺伝学・ゲノム情報などの予備知識を含めて丁寧に解説。
解析の「対象」「目的」「手法」を順序立てて説明することで、独習に役立つよう工夫されています。
基礎理論だけでなく実際に解析できるゲノム配列データも用意され、多型の検出・表現型解析・集団構造の可視化・正の自然選択の検出などのさまざまな解析手法を、ソフトウェアと書籍内のコードを用いて1ステップずつ実践できます。
また巻末の付録では、解析に用いるUNIXコマンドや環境構築についてもフォローされています。
これからゲノム多様性解析の世界に入門する研究者におすすめの1冊です。